新冠病是怎么产生的?美国研究发现可追溯至2009年

 admin   2025-04-23 01:15   16 人阅读  0 条评论

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文字|郑伟斌

2月18日,哥伦比亚大学和哈佛大学的研究团队在预印本bioRxiv上发表论文《重组和趋同进化导致2019年武汉冠状病的出现》。

论文指出,通过对病基因的研究发现,2019新型冠状病可能早在2009年就通过重组获得了SARS的基因特征,然后通过融合进化成了今天的新型冠状病。

新型冠状病是一种以前从未发现过的新型RNA冠状病。它与SARS病在核苷酸水平上有80%的相似性。

SARS病和新型冠状病都属于目前已知能够感染人类的冠状病亚属Sarbecovirus。该属的其他病也经常出现在蝙蝠身上。

病群体定植新宿主的能力可以通过快速突变率和重组等因素来解释。一般来说,这些因素导致病的高遗传变异性和高进化率,估计每年每个位点发生10-4至10-3次替换。

此前对冠状病的全基因组分析估计,冠状病的进化速度与其他快速进化的RNA病相同;然而,值得注意的是,冠状病的刺突基因比同一病中的其他基因进化得更快。该基因编码的蛋白质是感染体的关键组成部分,可以与宿主细胞受体相互作用。

冠状病基因重组离不开S蛋白

因此,研究团队试图分析新冠病的基因,以确认病的起源以及它是如何进化的。

首先,研究小组重点研究重组如何驱动冠状病在不同亚属病和宿主之间进化。为此,研究小组分析了来自感染哺乳动物的5个主要亚属的45个冠状病序列;最终,他们发现冠状病在跨病亚属重组基因和宿主时经常涉及S蛋白。

在此基础上,研究团队进一步研究了MERS病的重组是否也涉及S蛋白。

选择MERS病进行更深入的分析,因为它是最接近的可以感染人类和动物的病;同时,从人类和骆驼身上采集了大量样本。研究发现MERS病也大量参与S蛋白的重组。

新的冠状病是通过重组产生的

那么新冠病的祖先最早的重组事件是什么时候发生的呢?

通过一系列分析,研究小组在spike基因中发现了三个可以支持RBD潜在重组的位点。RBD(即受体结合域)是病表面蛋白用于与受体结合的部分。病利用它与人体细胞上的受体结合。

同时,研究还发现RBD中存在显着的重组事件,影响了新冠病和人类SARS病,且RaTG13病、新冠病和人类SARS病共有47个氨基酸,但其序列并不相同。蝙蝠SARS病。

这可以证明新冠病的RBD区域与人类SARS病具有相似的基因型,并且是通过重组产生的。

“新型冠状病”最晚可能发生在2009年

为了追踪这种重组发生的时间,研究小组使用了贝叶斯谱系进展方法,并将其与整个基因组谱系进行了比较。他们发现,新型冠状病和RaTG13病属于同一个分支,而人类SARS病则属于另一个分支。

图片说明RBD的时间发育谱系,包括RaTG13病、3个新冠病序列、6个蝙蝠SARS病序列和9个人类SARS病序列。据推测,至少11年前,甚至可能28年前,就有可能进行过重组。

基于这些发现,团队提出了两种可能性。第一种可能是新型冠状病起源于人类SARS病与另一种类SARS病重组;第二种可能性是至少发生了两次不同的重组事件,其中一次导致了人类SARS病。另一种病产生了这种新的冠状病。

但无论是哪一种,研究小组得出的结论是,导致RaTG13病和新冠病“共同祖先”产生的重组事件最晚在2009年就已经发生了。

此外,研究团队还发现,自从重组发生以来,RBD区域出现了大量取代的氨基酸,其中包括40多个具有SARS特征的氨基酸,使这些病能够适应人类。

对于这两个过程,研究团队甚至推断,它们可能早在2003年SARS爆发时就已经发生了。从那时起,冠状病就获得了感染人类宿主的能力。

郑伟斌

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